醫(yī)院源于1978年成立的青島醫(yī)學(xué)院心血管病研究室。
1993年5月,經(jīng)國家教委批準(zhǔn),原青島大學(xué)、山東紡織工學(xué)院、青島醫(yī)學(xué)院和青島師范專科學(xué)校合并組建新的青島大學(xué)。醫(yī)院名稱為”青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬心血管病醫(yī)院“。
1994年,醫(yī)院在青島市市南區(qū)芝泉路5號揭牌開業(yè)。
2013年,醫(yī)院更名為“青島大學(xué)心血管病研究所(青島大學(xué)附屬心血管病醫(yī)院)。